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📊 RNA-seq: 转录组数据分析处理(上) 🧬
袁华蝶2025-03-26 02:45:17 科技 -
导读 在基因组学研究中，RNA-seq技术是探索转录组的重要工具。然而，在正式分析之前，原始数据(raw data)的预处理至关重要。首先，我们需要检查...
在基因组学研究中，RNA-seq技术是探索转录组的重要工具。然而，在正式分析之前，原始数据(raw data)的预处理至关重要。首先，我们需要检查数据质量，确保没有低质量序列影响后续分析。用FastQC工具可以快速评估数据质量，如果发现质量问题，比如碱基质量偏低或适配器污染(adaptor contamination)，就需要进行初步清洗(cleaning)。Trim Galore! 或 Fastp 是常用的清洗工具，它们能有效去除低质量序列和适配器序列，从而提高数据可靠性。此外，还需要对数据进行去重(deduplication)，以减少重复序列对结果的影响。通过这些步骤，我们可以获得更干净、更可靠的RNA-seq数据，为后续的差异表达分析奠定坚实基础！✨
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